\u200bNovootkriveni mikrob, privremeno nazvan Sukunaarchaeum, nije virus. Ali, poput virusa, izgleda da ima samo jednu svrhu \u2013 da stvara jo\u0161 svojih kopija.<\/p>\n
Koliko nau\u010dnici mogu da zaklju\u010de iz njegovog genoma \u2013 jedinog dokaza o njegovom postojanju do sada \u2013 rije\u010d je o parazitu koji ne pru\u017ea ni\u0161ta organizmu u kojem boravi. Ve\u0107ina od svega 189 gena koji kodiraju proteine u Sukunaarchaeumu posve\u0107ena je replikaciji sopstvenog genoma; sve ostalo \u0161to mu je potrebno mora da ukrade od svog doma\u0107ina Citharistes regius, dinoflagelata koji \u017eivi u okeanskim vodama \u0161irom svijeta. Jo\u0161 ve\u0107u misteriju izaziva to \u0161to neki njegovi genetski sekvencioni ukazuju da pripada arhejama \u2013 grupi jednostavnih \u0107elijskih organizama koji su bli\u017ei slo\u017eenim organizmima poput ljudi, nego bakterijama poput Escherichia coli.<\/p>\n
Otkri\u0107e \u010dudnog, virusima sli\u010dnog na\u010dina \u017eivota Sukunaarchaeuma, objavljeno pro\u0161log mjeseca na bioRxiv-u, “dovodi u pitanje granice izme\u0111u \u0107elijskog \u017eivota i virusa”, ka\u017ee Kejt Adamala, sintetska biolog iz Univerziteta Minesote, koja nije u\u010destvovala u istra\u017eivanju. “Ovaj organizam bi mogao biti fascinantan \u017eivi fosil \u2013 evolutivna prekretnica koja je uspjela da opstane”, isti\u010de ona.<\/p>\n
Sukunaarchaeum je otkriven slu\u010dajno. Istra\u017eiva\u010di sa Univerziteta u Cukubi poku\u0161avali su da sekvenciraju sav DNK unutar \u0107elija C. regius, jer je ve\u0107 bilo poznato da ovaj dinoflagelat udomljava simbiotske cijanobakterije. Me\u0111utim, pored o\u010dekivanih DNK sekvenci dinoflagelata i cijanobakterija, kao i genoma mogu\u0107ih bakterijskih parazita, primijetili su neobi\u010dnu kru\u017enu DNK dugu samo 238.000 baza \u2013 svega pet odsto du\u017eine genoma E. coli.<\/p>\n
“U po\u010detku smo mislili da je ovaj mali kru\u017eni genom neka vrsta artefakta”, ka\u017ee Takuro Nakajama, evolucioni mikrobiolog sa Cukube.<\/p>\n
Ali kada su Nakajama i njegovi saradnici koristili vi\u0161e razli\u010ditih metoda za sekvenciranje i sastavljanje genoma, ova DNK petlja se stalno pojavljivala. Tim je na kraju morao da zaklju\u010di da neka druga jedinka, vjerovatno arheja, \u017eivi unutar C. regius.<\/p>\n
Sa o\u010diglednom nesposobno\u0161\u0107u da \u017eivi van doma\u0107ina, i genomom koji je manje od polovine veli\u010dine dosad najmanjeg poznatog arhejskog genoma, Sukunaarchaeum \u2013 jo\u0161 uvijek nezvani\u010dno ime inspirisano Sukuna-biko-nom, bo\u017eanstvom niskog rasta iz japanske mitologije \u2013 jedinstven je me\u0111u arhejama. Ne posjeduje najmanji mikrobni genom \u2013 ta \u010dast pripada bakteriji koja \u017eivi u insektima koji se hrane sokovima biljaka i ima samo 160.000 baza. Ipak, ta bakterija sadr\u017ei gene koji proizvode molekule korisne za njenog doma\u0107ina.<\/p>\n
Nasuprot tome, Nakajama ka\u017ee da Sukunaarchaeum nema “gotovo ni jedan prepoznatljiv metaboli\u010dki put”. To zna\u010di da vjerovatno ne mo\u017ee sam da proizvodi osnovne molekule \u2013 poput aminokiselina koje \u010dine proteine ili nukleotida koji \u010dine DNK \u2013 \u0161to sugeri\u0161e da ima “parazitski ili jednostrano eksploatatorski odnos” sa doma\u0107inom. Dodaje da, kao i virusi, Sukunaarchaeum gotovo u potpunosti zavisi od \u0107elijskog mehanizma C. regius-a.<\/p>\n
Ipak, Sukunaarchaeum se u jednoj bitnoj stvari razlikuje od virusa: mo\u017ee da replicira svoj sopstveni genetski materijal. Virusi obi\u010dno moraju da “otmu” \u0107elije doma\u0107ina da bi pravili svoje kopije. Ali gotovo svi identifikovani geni Sukunaarchaeuma povezani su sa replikacijom DNK, transkripcijom i translacijom. Ipak, Nakajama ka\u017ee da mikrobova “intenzivna fokusiranost na sopstveno razmno\u017eavanje, \u010dak i nau\u0161trb gotovo svih metaboli\u010dkih funkcija, podsje\u0107a na virusne strategije.”<\/p>\n
Elizabet Voters, biolog sa Dr\u017eavnog univerziteta u San Dijegu, koja je 2003. bila dio tima koji je objavio prvi genom arhejskog parazita koji parazitira na drugim arhejama, nije sasvim uvjerena da je Sukunaarchaeum u procesu postajanja virusom.<\/p>\n
“To je pomalo preuranjen zaklju\u010dak”, ka\u017ee, ali dodaje: “ako je ta\u010dno \u2013 nevjerovatno.” Bez obzira na to, smatra da je mikrob “fascinantan” i vjeruje da \u0107e Sukunaarchaeum omogu\u0107iti osnovna, uzbudljiva istra\u017eivanja o tome kako se razvijaju genomi.<\/p>\n
Adamala dodaje da, ako Sukunaarchaeum zaista predstavlja mikrob koji je na putu da postane virus, to bi moglo da nau\u010dnicima pru\u017ei uvid u to kako su virusi uop\u0161te nastali.<\/p>\n
“Ve\u0107ina najve\u0107ih evolutivnih prelaza nije ostavila fosilne tragove, \u0161to ote\u017eava razumijevanje ta\u010dnih koraka”, ka\u017ee ona i dodaje:<\/p>\n
“Mo\u017eemo da manipuli\u0161emo postoje\u0107om biohemijom kako bismo poku\u0161ali da rekonstrui\u0161emo drevne oblike \u2013 ili nam priroda ponekad da poklon, u vidu pre\u017eivjelog evolutivnog prelaza.”<\/p>\n
Ve\u0107 sada je jasno: Sukunaarchaeum nije usamljen. Kada su Nakajama i njegovi saradnici analizirali javno dostupne DNK sekvence iz morske vode \u0161irom svijeta, prona\u0161li su mnoge sekvence sli\u010dne onima Sukunaarchaeuma.<\/p>\n
“Tada smo shvatili da nismo otkrili samo jedno \u010dudno bi\u0107e, ve\u0107 smo identifikovali prvi potpuni genom velike, dosad nepoznate linije arheja”, ka\u017ee Nakajama.<\/p>\n
Tim sada poku\u0161ava da napravi fotografiju Sukunaarchaeuma \u2013 \u0161to nije lako, s obzirom na to da je vjerovatno manji od jednog mikrona. Arhejski parazit koji je prou\u010davala Voters, a koji ima vi\u0161e nego dvostruko ve\u0107i genom od Sukunaarchaeuma, ima samo 400 nanometara u pre\u010dniku. Istra\u017eiva\u010di tako\u0111e poku\u0161avaju da utvrde kako se ova grupa odnosi prema drugim arhejama \u2013 da li ima bliskih slobodno\u017eive\u0107ih ro\u0111aka, na primjer \u2013 i da otkriju \u0161ta ta\u010dno rade proteini ovog mikroba, uklju\u010duju\u0107i nekoliko velikih, membranskih proteina koji mogu biti klju\u010dni za interakciju sa doma\u0107inom.<\/p>\n
Za Adamalu, ovo otkri\u0107e je podsjetnik na to koliko jo\u0161 toga ostaje da se otkrije.<\/p>\n
“Ovo istra\u017eivanje pokazuje koliko je biologija jo\u0161 uvijek luda, prelijepa i nedovoljno shva\u0107ena”, ka\u017ee ona. (Izvor:Telegraf Nauka).<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
\u200bNovootkriveni mikrob, privremeno nazvan Sukunaarchaeum, nije virus. Ali, poput virusa, izgleda da ima samo jednu svrhu \u2013 da stvara jo\u0161 svojih kopija.<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":284840,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_seopress_robots_primary_cat":"none","_seopress_titles_title":"","_seopress_titles_desc":"","_seopress_robots_index":"","_et_pb_use_builder":"","_et_pb_old_content":"","_et_gb_content_width":"","inline_featured_image":false,"footnotes":""},"categories":[8],"tags":[],"class_list":["post-432509","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-svastara"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/432509","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=432509"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/432509\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":432512,"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/432509\/revisions\/432512"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/media\/284840"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=432509"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=432509"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pcnen.com\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=432509"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}